Для того чтобы врач мог лечить пациента, необходимо сначала установить точную причину его заболевания. Если причиной является вирус, то существующие диагностические тесты часто недостаточно чувствительны для обнаружения вируса, или врач должен уже подозревать, какой именно вирус вызывает симптомы, прежде чем он сможет назначить соответствующий тест для их подтверждения. Однако новый тест, разработанный исследователями из Вашингтонского университета в Сент-Луисе, возможно, решил эту проблему. "ViroCap" - это новый диагностический тест, который может выявить любой вирус, заражающий людей и животных. Их работа была опубликована в журнале Genome Research.
"С этим тестом вам не нужно знать, что вы ищете", - сказал старший автор исследования Грегори Сторч в пресс-релизе.
Для разработки теста исследователи собрали уникальные последовательности ДНК и РНК всех групп вирусов, известных для заражения людей и животных - на данный момент они включили до 2 миллионов уникальных фрагментов генетического материала. Для проведения теста эти уникальные последовательности сравниваются с генетическим материалом, обнаруженным в крови, кале или мокроте пациента. Если есть совпадение, этот материал затем анализируется с помощью высокопроизводительного генетического секвенирования для постановки диагноза.
Исследователи надеются использовать новый метод для обнаружения вспышек смертельных вирусов, таких как Эбола, Марбург и ТОРС, а также вирусов, вызывающих тяжелые желудочно-кишечные инфекции, таких как ротавирус и норовирус, говорится в пресс-релизе.
В ходе предварительных испытаний, проведенных на двух группах детей в детской больнице Сент-Луиса, исследователи, использовавшие новую методику, обнаружили 52-процентное увеличение числа выявленных вирусов по сравнению с традиционными методами. Тест также способен обнаружить очень незначительные генетические вариации внутри одного и того же типа вируса, что, по мнению ученых, может быть полезно для определения типа вируса гриппа у пациента, например, H3N2, особого сурового подтипа сезонного вируса.
Хотя тест не будет доступен для клинического использования в течение нескольких лет (по словам исследователей, для подтверждения его точности необходимы дополнительные исследования), сама технология может быть немедленно применена в исследованиях, изучающих "виром" - собирательный термин для всех вирусов, которые живут на человеческом теле или в нем. Для этого исследователи планируют сделать технологию общедоступной. Кроме того, исследователи надеются использовать механизмы теста для изучения других патогенов, таких как бактерии и грибки.