Города имеют уникальные микробиомы, которые могут быть ключом к сохранению нашего здоровья

Исследователи взяли мазки из городских автобусов и метро и обнаружили ДНК вирусов и бактерий, которые никогда ранее не были классифицированы.

Отредактировано 2023-17-06
Международная группа исследователей взяла мазки с билетных киосков поручней сидений турникетов и других поверхностей подвергающихся интенсивному воздействию в системах общественного транспорта городов по всему миру Исследователи обнаружили что микробные сообщества в разных городах имеют различный состав или сигнатуры Международная группа исследователей взяла мазки с билетных киосков, поручней, сидений, турникетов и других поверхностей, подвергающихся интенсивному воздействию, в системах общественного транспорта городов по всему миру. Исследователи обнаружили, что микробные сообщества в разных городах имеют различный состав, или "сигнатуры".

Когда в мире становится одиноко, просто вспомните: Мы все маринуемся в общем чане микробной жизни. И это, по большей части, хорошо. Возможно, вы слышали о микробиоме кишечника человека - сообществе крошечных организмов в нашем пищеварительном тракте, которые могут влиять на наше здоровье все еще загадочными способами, но у городов тоже есть микробиом, и недавнее исследование показало, что он уникален, варьируясь по составу от города к городу.

Исследование, опубликованное 26 мая в журнале Cell, составило карту микробных сообществ в 60 городах на шести континентах, проанализировав более 4700 образцов, взятых из метро и автобусных систем, чтобы получить представление о бактериях, вирусах и археях, которые там обитают. "Мы и раньше знали, что на каждом турникете и скамейке нас поджидают тысячи видов", - говорит ведущий автор исследования Крис Мейсон, доцент медицинского центра Weill Cornell в Нью-Йорке. "Но у нас не было представления о том, насколько эти микробиомы отличаются в разных городах".

Международная группа исследователей в течение трех лет брала мазки с билетных киосков, перил, сидений, турникетов и других поверхностей, к которым часто прикасаются в системах общественного транспорта в разных городах мира, включая Боготу, Нью-Йорк и Токио. Исследователи обнаружили последовательную группу из 31 "основного" вида, встречающегося почти во всех местах, включая такие виды, как Cutibacterium acnes, распространенный вид бактерий, живущий на коже человека. Но они также обнаружили, что микробные сообщества в разных городах имели различные составы, или "сигнатуры".

Эти различия могут быть частично обусловлены разной окружающей средой, с разной температурой и уровнем влажности, говорит Мейсон. В разных городах они также обнаружили разное количество генов, сигнализирующих о потенциальной устойчивости к противомикробным препаратам - глобальной проблеме здравоохранения, - что, по мнению исследователей, может отражать типы антибиотиков, принимаемых на местах. Хорошей новостью, по словам Мейсона, является то, что по сравнению с образцами почвы или кишечника человека, в городской среде меньше генов, сигнализирующих об устойчивости к противомикробным препаратам. Исследователи также обнаружили большое количество ДНК вирусов и бактерий, которые ранее не были классифицированы.

"Каждый раз, когда вы садитесь [в метро], вы, возможно, сидите прямо над видом, который еще не обнаружен", - говорит Мейсон.

"Эта работа представляет собой первый всеобъемлющий обзор генов окружающей среды во всем мире", - написала Мария Глория Домингес-Белло, профессор микробиологии Ратгерского университета, не принимавшая участия в исследовании, в электронном письме в Popular Science. Она пишет, что это очень важно, поскольку дает новую информацию о нашей современной среде обитания, которая сильно отличается от той, в которой развивались наши предки.

[Подробнее: В почве бушуют войны бактерий, и это поддерживает здоровье экосистем]

"Исторически сложилось так, что когда мы думали о микробах, окружающей среде и здоровье, мы концентрировались на патогенах и старались максимально обеззараживать поверхности", - пишет Эрика Хартманн, доцент кафедры гражданского и экологического строительства Северо-Западного университета, которая не принимала участия в исследовании. Это было особенно актуально во время недавней пандемии COVID-19. "Если сделать шаг назад и посмотреть не только на патогены, но и на все микробы и увидеть, что есть на самом деле, это позволит нам взглянуть на ситуацию с другой стороны, что, надеюсь, приведет к более эффективным подходам к управлению нашими микробными сожителями" - например, к тому, чтобы обратить внимание на то, какие микробы присутствуют в норме, и пересмотреть, когда и какие дезинфицирующие средства могут понадобиться.

"Микробы окружают нас повсюду, и хотя некоторые из них могут вызывать у вас болезни, подавляющее большинство из них нейтральны или даже полезны", - добавил Хартманн. "Очень важно работать с микробами, а не против них, чтобы не создавать для себя более серьезных проблем, таких как супербактерии".

Поскольку более половины человечества живет в городах, городские службы, такие как системы общественного транспорта, "вероятно, являются самой большой общей тактильной экосистемой, которую мы все имеем", - говорит Мейсон. По его словам, понимание того, что обитает в этой экосистеме, может помочь нам выяснить, как сохранить устойчивые, разнообразные и более устойчивые к патогенам городские микробиомы.